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大规模代谢网络分解的生物信息学研究
引用本文:王正华,周婷婷.大规模代谢网络分解的生物信息学研究[J].国防科技大学学报,2008,30(3):48-52.
作者姓名:王正华  周婷婷
作者单位:国防科技大学,并行与分布处理国家重点实验室,湖南,长沙,410073
基金项目:国家自然科学基金 , 国家重点实验室基金
摘    要:随着大规模分子相互作用数据的不断涌现,生物学网络方面的研究正日益得到重视.代谢网络处于生物体的功能执行阶段,其结构组成方式不仅反映了生物体的功能构成,也直接影响代谢工程中的途径分析和研究.作为代谢网络研究的重要环节,实现网络的合理分解不仅对于基因组范围内分子网络的结构和功能研究具有重要意义,也是代谢工程的途径分析和优化得以顺利进行的前提之一.在回顾代谢网络宏观结构和拓扑特征研究成果的基础上,通过对现有分解方法的深入分析,指出缺乏合理且有针对性的模型评估准则是目前网络分解研究中亟待解决的问题之一.今后的研究趋势在于如何整合更多的信息和发展更先进的分析方法,建立更合理的模型,并进一步拓展网络分解的应用范围.

关 键 词:生物信息学  代谢网络  网络分解  评估准则  大规模  网络分解  生物信息学  研究趋势  Decomposition  Metabolic  Network  Analysis  Bioinformatics  应用  分解方法  发展  整合  问题  评估准则  模型  分析  特征研究  拓扑  宏观结构  前提
收稿时间:2007/11/20 0:00:00

A Review on Bioinformatics Analysis of Genome-scale Metabolic Network Decomposition
WANG Zhenghua and ZHOU Tingting.A Review on Bioinformatics Analysis of Genome-scale Metabolic Network Decomposition[J].Journal of National University of Defense Technology,2008,30(3):48-52.
Authors:WANG Zhenghua and ZHOU Tingting
Institution:WANG Zheng-hua,ZHOU Ting-ting(National Laboratory for Parallel & Distributed Processing,National Univ.of Defense Technology,Changsha 410073,China)
Abstract:As the large-scale data on molecular interaction available increases,the study on biological networks has ignited more and more attention.As the execution level of cellular functions,the structural composition of metabolic networks not only reflects the execution of cellular functions step by step,but also influences the pathway analysis of metabolic engineering.Hence,as a key step,a sound decomposition of global metabolic networks is not only significant for further exploring the structure and function of ...
Keywords:bioinformatics  metabolic network  network decomposition  evaluation criterion  
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