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1994年 | 2篇 |
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RNA二级结构预测是生物信息学领域重要的研究方向,基于最小自由能模型的Zuker算法是目前该领域最典型使用最广泛的算法之一。本文基于CPU GPU的混合计算平台实现了对Zuker算法的并行和加速。根据CPU和GPU计算性能的差异,通过合理的任务分配策略,实现二者之间的并行协作计算和处理单元间的负载平衡;针对CPU和GPU的不同硬件特性,对Zuker算法在CPU和GPU上的实现分别采取了不同的并行优化方法,提高了混合加速系统的计算性能。实验结果表明,CPU处理单元在混合系统中承担了14%以上的计算任务,与传统的多核CPU并行方案相比,采用混合并行加速方法可获得15.93的全局加速比;与最优的单纯GPU加速方案相比,可获得16%的性能提升,并且该混合计算方案可用于对其它生物信息学序列分析应用的并行和加速。 相似文献
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强军梦给直接抓战斗力生成的师旅级党委机关建设提出了更高要求。面对新要求、新挑战,机关科长应当在扮演好三种双重角色中凝心聚力,勇挑重担,履职尽责,争创一流。一、扮演好既是部属又是领导的双重角色(一)扮演好部属角色。科长与部队首长走得最近、接触最多、联系最频,是首长最直接、最信任、最得力的部属,应当具备三种过硬本领。 相似文献
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体制编制调整以来,各级坚持以习近平强军思想引领基层建设,注重转变观念、理顺关系、改进方式,确保了营级党委地位凸显、有效运转、作用发挥。近期通过对一些部队调研,对照"三个过硬"标准要求,感觉迫切需要强化营级党委领导力、组织力、执行力。一、突出政治功能,发挥凝心聚力"指挥所"的作用调研表明,有的营级党委坚持从思想上政治上建连育人还有差距,"中间"还没有成为"中坚"。抓不住思想聚力量。 相似文献
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针对图计算应用的访存特点,提出并实现一种支持高并发、乱序和异步访存的高并发访存模块(High Concurrency and high Performance Fetcher, HCPF)。通过软-硬件协同的设计方法,HCPF可同时处理192条共8种类型的内存访问请求,且访存粒度可由用户定义,满足图计算应用对海量低延迟细粒度数据访问的需求。同时,HCPF扩展了基于内存语义的跨计算节点定制互连技术,支持远程内存的细粒度直接访问,为后续实现分布式图计算框架提供技术基础。结合上述两个核心研究内容,基于流水线RISC-V处理器核,设计并实现了可支持HCPF的RISC-V片上系统(System-on-Chip,SoC)架构,搭建基于FPGA的原型验证平台,并使用自研测试程序对HCPF进行初步性能评测。实验结果表明,HCPF相比原有访存通路,最高可将基于数组和随机地址的两种随机内存访问性能分别提升至3.5倍和2.7倍。远程内存直接访问4 Byte数据的延时仅为1.63μs。 相似文献
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