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应用建立的氨基酸结构描述符c-scales和G/PLS统计方法,对ω-芋螺毒素中的N-型和P/Q-型钙离子通道拮抗剂进行了定量构效关系研究,两种亚型的QSAR模型的交叉验证相关系数XV-r^2和相关系数,都在0.96以上,表明模型均有较好的预测能力和拟合能力。通过对模型权重系数图的分析,直观了解两种亚型的ω-芋螺毒素类似物的结构对生物活性的影响,为进一步设计高活性的多肽类似物提供一定的理论依据。 相似文献
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利用Insight Ⅱ软件包中的Homology模块,通过同源建模的方法在SGI 02图形工作站上依据白喉毒素晶体结构,在其催化区的活性部位截取了S^146-Q^155,S^19-N^45,N^45-S^55和T^56-N^71 4个片段,每个片段只舍有1个α-螺旋。以此构象为结构基础,利用量子化学半经验AM1方法,分别对4个片段进行了量子化学计算,得到了重要的电子结构信息,为突变研究提供了理论依据。研究结果表明,在与受体相互作用时,能够提供电子的主要氨基酸是D^29,D^49,D^68,E^154,D^47,E^70,E^148;能够接受电子的主要氨基酸是K^39,F^53,K^59,Y^54,Y^149,K^3,K^24,W^153;能够同受体进行疏水作用的主要氨基酸是Y^20,H^21,Y^27,I^31,I^35,Y^46,W^50,Y^54,Y^60,Y^65,I^150,W^153,上述氨基酸都可能对活性产生重要影响。 相似文献
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重点探讨了药物或毒物分子设计过程中的定量构效关系、虚拟组合化学和虚拟筛选技术、密度泛函理论等重要新技术的发展,并对其在ADMET预测、受体和配体对接过程中精确打分函数的建立以及酶催化反应过渡态类似物设计等方面应用的国内外最新研究进展进行了详细阐述。 相似文献
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6β-乙酰氧基-8-氮杂双环[3,2,1]辛烷是合成托品生物碱的重要中间体,同时也是高活性的有机小分子化合物。本文对该化合物进行了量子化学计算,研究了它的电子结构,对所得结果进行了分析和讨论。 相似文献
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